COINCIDENCIAS DEL DIAGNÓSTICO DEL GÉNERO STREPTOCOCCUS ENTRE MÉTODO MANUAL Y EL MÉTODO AUTOMATIZADO EN EL LABORATORIO AUTOMATIZADO ZAMORA
No Thumbnail Available
Date
2024-10-01
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Universidad Técnica de Ambato / Facultad de Ciencias de Salud / Centro de Posgrados
Abstract
The genus Streptococcus sp. They are gram positive cocci; these bacteria grow in
chains or pairs which are oxidase and catalase negative. Among the groups that cause
disease in humans are the most frequent such as Streptococcus pyogenes (group A)
produces tonsillitis and impetigo, Streptococcus pneumoniae is the cause. Of the
majority of pneumonias acquired in the community, Streptococcus viridans and its
groups are the cause of dental abscesses, within the subgenus is Streptococcus mutas
the main agent that causes dental cavities and without forgetting that it causes
endocarditis is a common pathogen that causes severe and potentially complicated
infections with the possibility of generating serious sequelae, hence the importance of
rapid, accurate and timely identification. In this context, it is essential to evaluate the
available diagnostic methodologies to determine their relative effectiveness. In
particular, the performance of the manual method should be compared with the Vitek
2 Compact automated system, in order to evaluate the concordance between both
approaches in the identification of Streptococcus sp. The objective of this study is
To evaluate the agreement of the diagnosis of Streptococcus sp. between the manual
method and the automated method in the Zamora Automated Clinical Laboratory in
the period July and May 2023-2024. The methodology used for this study was
Quantitative, non-experimental, observational, descriptive study with verification of
coincidences in diagnostic tests for the identification of 100 culture samples with
growth for Streptococcus sp. in two laboratories, verification of coincidences in
diagnostic tests for identification in 100 culture samples with growth for Streptococcus
sp. in two laboratories, using conventional and automated methods (Vitek 2 Compact).
To obtain results, tests were carried out to
Differentiation tests were performed, obtaining 100% negative catalase, 100% alpha
hemolysis, 100% resistant bacitracin, 94% resistant optochin. The identification of
pathogens of the genus Streptococcus sp. was carried out using two different methods:
one manual and the other automated. The manual method, revealed the following
proportions: 94% corresponded to Streptococcus of the viridans group, 6% to S.
pneumoniae, and 0% to S. pyogenes. On the other hand, the automated method provide
results with 89% of S. viridans, 6% of S. pneumoniae and 0% of S. pyogenes. These
findings show a slight discrepancy in the proportion of S. viridans identified by both
methods, while the identities of S. pneumoniae and S. pyogenes remained constant between the two analytical approaches. The kappa index determined a concordance of
1 (almost perfect) according to the table between both methods for the identification
of S. pneumoniae and 0.635 (considerable for identifying S. viridans. Based on these
findings, a proposal was designed for the improvement of diagnostic skills according
to the results obtained, the identification of the
Streptococcus sp. by the manual method compared to the automated methodology
(Vitek 2 Compact), presents high concordance, especially with S. pneumoniae.
Strategies must be reviewed and implemented to improve the identification of this
pathogen in laboratories how is the implementation of the automated equipment since
it has a better identification in the subgenera of the viridans group which are of clinical
interest in the dental area
Description
El género Streptococcus sp. son cocos gram positivos, estas bacterias crecen en
cadenas o pares los cuales son oxidasa y catalasa negativos entre los grupos que causan
enfermedad a los humanos están los más frecuentes como el Streptococcus pyogenes
(grupo A) produce amigdalitis e impétigo, el Streptococcus pneumoniae es causante
de la mayoría de neumonías adquiridas en la comunidad, Streptococcus viridans y sus
grupos es el causante de abscesos dentales, en dentro de sub genero está el
Streptococcus mutas el principal agente que causa las caries dentales y sin olvidar que
este causa endocarditis. Representa un patógeno común que puede inducir infecciones
severas y potencialmente complicadas, con la posibilidad de generar secuelas graves.
La identificación rápida, precisa y oportuna de este microorganismo es, por tanto, de
suma importancia. En este contexto, se torna esencial evaluar las metodologías
diagnósticas disponibles para determinar su eficacia relativa. En particular, se debe
comparar el rendimiento del método manual con el del sistema automatizado Vitek 2
Compact, con el fin de evaluar la concordancia entre ambos enfoques en la
identificación de propues. El objetivo de este estudio es evaluar la concordancia del
diagnóstico de Streptococcus sp entre el método manual y el método automatizado en
el Laboratorio Clínico Automatizado Zamora en el periodo julio y mayo 2023-2024.
La metodología empleada para este estudio fue cuantitativo, no experimental,
observacional, descriptivo con verificación de coincidencias en las pruebas
diagnósticas para la identificación en 100 muestras de cultivo con crecimiento para
Streptococcus sp en dos laboratorios, utilizando métodos convencionales y
automatizados (Vitek 2 Compact). Para la obtención de resultados se realizaron
pruebas para la diferenciación, obteniendo catalasa negativa 100%, alfa hemolisis
100%, bacitracina resistente 100%, optoquina resistente 94%. La identificación de los
patógenos del género Streptococcus sp. se llevó a cabo utilizando dos métodos
distintos: manual y automatizado. El método manual reveló las siguientes
proporciones: 94% correspondieron a Streptococcus del grupo viridans, 6% a
Streptococcus pneumoniae, y 0% a Streptococcus pyogenes. En contraste, el método
automatizado proporcionó resultados con 89% de S. viridans, 6% de S. pneumoniae y
0% de S. pyogenes. Estos resultados evidencian una ligera discrepancia en la
proporción de S. viridans identificada por ambos métodos, mientras que las proporciones de S. pneumoniae y S. pyogenes se mantuvieron constantes entre los dos
enfoques analíticos. La índice kappa indicó una concordancia de 1 (casi perfecta) para
la identificación de S. pneumoniae y de 0.635 (considerable) para la identificación de
S. viridans. Con base en estos hallazgos, se diseñó una propuesta para la mejora de
habilidades diagnósticas conforme a los resultados obtenidos se concluyó la
identificación del Streptococcus sp por el método manual en comparación con la
metodología automatizada (Vitek 2 Compact), presenta una alta concordancia,
especialmente con el S. pneumoniae. Se requiere revisar e implementar estrategias para
mejorar la identificación de este patógeno en laboratorios como es la implementación
del equipo automatizado puesto que tiene una mejor identificación en los sub géneros
del grupo viridans los cuales son de interés clínico en el área odontológica.
Keywords
STREPTOCOCCUS, PATÓGENO, INFECCIONES, VITEK 2 COMPACT, DIAGNÓSTICO, AUTOMATIZADO