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Título : Estudios bioinformáticos para la identificación de posibles dianas terapéuticas en la enfermedad de la Diabetes Mellitus tipo 2 (T2DM)
Autor : Galarza Galarza, Cristian Fernando
Guevara Proaño, Luis David
Palabras clave : BIOINFORMÁTICA
CRIBADO VIRTUAL
DISEÑO DE FÁRMACOS
ACOPLAMIENTO MOLECULAR
DIABETES MELLITUS TIPO 2
T2DM
Fecha de publicación : mar-2022
Editorial : Universidad Técnica de Ambato. Facultad de Ciencia e Ingeniería en Alimentos y Biotecnología. Carrera de Ingeniería Bioquímica
Resumen : The search for therapeutic targets for the disease type 2 diabetes mellitus is based on computer-aided drug development through molecular concentration analysis and virtual screening in disease databases. The identification of the study gene requires analysis in different databases such as MalaCards, OMIM, Harmonizome and KEGG to validate the information on the genes involved in the disease. Thus, the genes with the greatest connections are chosen and grouped according to their genetic dysfunction to create biological networks and validated in the DrugBank database. Subsequently, an analysis of the metabolic pathway taken from KEGG that connect the target genes that maintain the identified mutation is performed and the three-dimensional structures are used to evaluate the domains plus drugs. Molecular coupling and screening simulations are then carried out, considering the compounds with the highest affinity for IRS-1, and finally the toxicity of the drugs is analyzed. QSAR models show that Zosuquidar, Rimacalib, Uk432097, Mosapramine, Devazepide and Setipiprant are the safest ligand compounds in toxicity analyses. The present study is based on the identification of the genes most associated with T2DM and the search for possible therapeutic targets through bioinformatics applied to computer-assisted drug design. The results obtained can be used for subsequent research studies to increase the therapeutic spectrum for T2DM or other metabolic degenerations.
Descripción : La búsqueda de dianas terapéuticas para la enfermedad de la diabetes mellitus tipo 2 se fundamenta en el desarrollo de fármacos asistido por computadora a través de análisis de acoplamiento molecular y cribado virtual en bases de datos de enfermedades. La identificación del gen de estudio requiere de análisis en diferentes bases de datos como MalaCards, OMIM, Harmonizome y KEGG para validar la información sobre los genes involucrados en la enfermedad. Así, se escoge a los genes con mayor correlación y son agrupados de acuerdo con su disfunción genética para crear redes biológicas y validados en la base de datos DrugBank. Posteriormente, se realiza un análisis de la ruta metabólica tomada de KEGG que conectan los genes objetivos que mantienen la mutación identificada y se utilizan las estructuras tridimensionales para evaluar los dominios más drugables. A continuación, se realizan las simulaciones de acoplamiento molecular y cribado que consideran a los compuestos con mayor afinidad a IRS-1 y finalmente se analiza la toxicidad de los fármacos. Los modelos QSAR demuestran que Zosuquidar, Rimacalib, Uk432097, Mosapramine, Devazepide y Setipiprant son los compuestos ligandos con mayor seguridad en los análisis de toxicidad. El presente estudio se fundamenta en la identificación de los genes con mayor asociación a la T2DM y la búsqueda de posibles dianas terapéuticas mediante bioinformática aplicada al diseño de fármacos asistido por computadora. Los resultados obtenidos pueden ser tomados por estudios posteriores de investigación para aumentar el espectro terapéutico a la T2DM u otras degeneraciones metabólicas.
URI : https://repositorio.uta.edu.ec/jspui/handle/123456789/34969
Aparece en las colecciones: Carrera Ingeniería Bioquímica

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