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Título : Cribado virtual de inhibidores de la enzima Mpro del virus SARS-CoV-2 empleando librerías de compuestos y homología estructural con proteasas de virus patógenos de animales
Autor : García Solís, Mario Daniel
Ramos Aristimbay, María Lisette
Palabras clave : BIOINFORMÁTICA
CRIBADO VIRTUAL
DOCKING MOLECULAR
ACTIVIDAD ANTIVIRAL
INHIBIDORES ENZIMÁTICOS
PROTEASA MPRO
SARS-COV-2
CORONAVIRUS
Fecha de publicación : ene-2021
Editorial : Universidad Técnica de Ambato. Facultad de Ciencia e Ingeniería en Alimentos y Biotecnología. Carrera de Ingeniería Bioquímica
Resumen : The purpose of this study is to perform virtual screening of SARS-CoV-2 virus Mpro enzyme inhibitors using compound libraries and structural homology with animal pathogenic virus proteases. In response to the present pandemic the world is going through, caused by COVID-19, so it is of paramount importance to search for compounds, which prevent the spread of SARS-CoV-2, with which medicines can be made to curb the contagions of this disease. Since the main protease Mpro is responsible for carrying out the proteolytic processes during the replication of the virus, it has been selected as a target for the search for molecules that inhibit its activity, thus preventing the virus from continuing to multiply. For this, a homology analysis was performed that could identify that this protease is preserved in several species of coronavirus that infect animals, such as those that cause murine hepatitis, swine transmissible gastroenteritis, feline peritonitis, and avian infectious bronchitis. Which allowed us to look for compounds used to treat these diseases, and to create a library with the most effective ligands. This was able to determine the druggable sites of the enzyme and perform a molecular coupling (docking), identifying ten inhibitors that best bind to Mpro, including Ritonavir, with which, through subsequent in vitro studies, COVID-19 drugs could be generated, and tested in other coronaviruses with which homology exists.
Descripción : El presente estudio tiene como propósito realizar un cribado virtual de inhibidores de la enzima Mpro del virus SARS-CoV-2 empleando librerías de compuestos y homología estructural con proteasas de virus patógenos de animales. En respuesta a la presente pandemia por la que está atravesando el mundo, causada por el COVID-19, por lo que es de suma importancia la búsqueda de compuestos, que eviten la propagación del SARS-CoV-2, con los que se puedan realizar medicamentos para frenar los contagios de esta enfermedad. Dado que la proteasa principal Mpro es la encargada de llevar a cabo los procesos proteolíticos durante la replicación del virus, se la ha seleccionado como target para la búsqueda de moléculas que inhiban su actividad, evitando así que el virus continúe multiplicándose. Para esto, se realizó un análisis de homología con el que se pudo identificar que esta proteasa se encuentra conservada en varias especies de coronavirus que infectan a animales, como aquellos que causan la hepatitis murina, la gastroenteritis transmisible porcina, la peritonitis felina y la bronquitis infecciosa aviar. Lo que permitió buscar compuestos que se utilicen para tratar estas enfermedades, y crear una librería con los ligandos más efectivos. Con esto se pudo determinar los sitios drogables de la enzima y realizar un acoplamiento molecular (docking), identificando diez inhibidores que se unen mejor a Mpro, entre ellos el Ritonavir, con los que, mediante posteriores estudios in vitro, se podrían generar fármacos contra el COVID-19, y además probarlos en otros coronavirus con los que existe homología.
URI : https://repositorio.uta.edu.ec/jspui/handle/123456789/32116
Aparece en las colecciones: Carrera Ingeniería Bioquímica

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