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https://repositorio.uta.edu.ec/jspui/handle/123456789/32091
Título : | Análisis bioinformático de bacterias con capacidad degradadora de hidrocarburos |
Autor : | Terán Mera, David Andrés Guerra Ortiz, Jessica Estefanía |
Palabras clave : | BIOINFORMÁTICA FILOGENIA MICROBIANA CONTAMINACIÓN AMBIENTAL BACTERIAS INDÍGENAS HIDROCARBUROS |
Fecha de publicación : | ene-2021 |
Editorial : | Universidad Técnica de Ambato. Facultad de Ciencia e Ingeniería en Alimentos y Biotecnología. Carrera de Ingeniería Bioquímica |
Resumen : | The bioinformatic analyzes carried out focused on hydrocarbon degrading bacteria and the mechanisms they use for the degradation of these compounds. It seeks to understand the evolution of these over time, considering the evolutionary and structural relationship of certain enzymes (monooxygenase and dioxygenases), among these: benzene 1,2-monooxygenase, phenol 2-monooxygenase, toluene 2-monooxygenase, toluene methyl monooxygenase, toluene dioxygenase and toluene 2-monooxygenase. The meta-analysis process consisted of determining the bacteria capable of degrading hydrocarbons, as well as the definition of the metabolic routes used for the transformation of toluene and benzene and the corresponding enzymes (Total: 7). The phylogeny process of the enzymes was carried out based on hydrocarbons (toluene and benzene), a BLAST of each of the enzymes was carried out and individual and group phylogenetic trees were constructed. Based on this information, the evolution of enzymes was understood, and common ancestors were defined, obtaining that there are still conserved sequences among all enzymes. The last analysis performed was the structural analysis of 5 enzymes, where they were compared with each other, thus defining the structural similarity. Based on this, it was obtained that there are partial similarities between the enzymes, which participate in the different metabolic pathways, as stated above. The study of this work is important because each of the results obtained may contribute to the development of synthetic enzymes at an industrial level, for greater efficiency in the bioremediation of soils and waters contaminated by oil spills. |
Descripción : | Los análisis bioinformáticos realizados se enfocaron en las bacterias degradadoras de hidrocarburos y en los mecanismos que usan para la degradación de estos compuestos. Se busca comprender la evolución de estas a través del tiempo, tomado en cuenta la relación evolutiva y estructural de ciertas enzimas (monooxigenasa y dioxigenasas), entre estas: benceno 1,2 monooxigenasa, fenol 2-monooxigenasa, tolueno 2-monooxigenasa, tolueno metil monooxigenasa, tolueno dioxigenasa y tolueno 2-monooxigenasa. El proceso de metaanálisis consistió en determinar las bacterias capaces de degradar hidrocarburos, así como la definición de las rutas metabólicas usadas para la transformación de: tolueno y benceno y las enzimas correspondientes (Total:7). El proceso de filogenia de las enzimas se llevó a cabo basándose en los hidrocarburos (tolueno y benceno), se realizó un BLAST de cada una de las enzimas y se construyó arboles filogenéticos individuales y grupales. Basada en esta información se comprendió la evolución de las enzimas y se definió ancestros en común, obteniendo que existe aún secuencias conservadas entre todas a enzimas. El último análisis realizado fue el análisis estructural de 5 enzimas, donde se compararon entre sí, definiendo así la similaridad estructural. En base a esto se obtuvo que existe similitudes parciales entre las enzimas, que participan en las diferentes rutas metabólicas, afirmado lo antes propuesto. El estudio del presente trabajo es importante debido que cada uno de los resultados obtenidos, pueden contribuir al desarrollo de enzimas sintéticas a nivel industrial, para mayor eficiencia en la a biorremediación de suelos y aguas contaminados por derrames de petróleo. |
URI : | https://repositorio.uta.edu.ec/jspui/handle/123456789/32091 |
Aparece en las colecciones: | Carrera Ingeniería Bioquímica |
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