Detección de genes AVR y ECP en aislados de Cladosporium fulvum Cooke. del cantón Tisaleo
Date
2025-08
Authors
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Publisher
Abstract
Leaf mold is a disease caused by the biotrophic fungus Cladosporium
fulvum Cooke in kidney tomato (Solanum lycopersicum L.) crops. Tomato plants
possess resistance (R) genes that trigger a hypersensitive response (HR) upon detecting
an avirulence (Avr) gene or extracellular protein (Ecp) gene from C. fulvum. The
objective of this study was to detect the presence or absence of Avr and Ecp genes in
10 monosporic isolates from Tisaleo Canton by standardizing protocols for mycelial
reactivation, DNA extraction, and endpoint PCR. The following annealing
temperatures were used: 58°C, 61°C, 64°C, 59°C, 63°C, 60°C, 58°C, and 55°C for the
genes Avr2, Avr4, Avr4-E, Avr9, Ecp1, Ecp2, Ecp4, and Ecp5, respectively. The
amplified product was loaded onto a 1% agarose gel and subjected to electrophoresis
at 100V for 45 minutes. The results were visualized under UV light using a
transilluminator.It was determined that all isolates from Tisaleo exclusively contained
the Avr2 gene, along with Ecp1 and Ecp2. This study constitutes the first report on the
presence of Avr and Ecp genes in C. fulvum isolates from Tisaleo, Tungurahua
Province.
Description
El moho gris de la hoja es una enfermedad causada por el hongo biotrófico
Cladosporium fulvum Cooke. en el cultivo del tomate riñón (Solanum lycopersicum
L.), el tomate posee genes de resistencia R que al detectar un gen de avirulencia (Avr)
o genes de proteínas extracelulares (Ecp) de C. fulvum manda una respuesta de
hipersensibilidad (HR). El objetivo de esta investigación fue detectar la presencia o
ausencia de los genes Avr y Ecp en 10 aislados monospóricos del cantón Tisaleo
mediante la estandarización de los protocolos para la reactivación del crecimiento del
micelio, extracción de ADN y PCR tiempo final usando las siguientes condiciones de
anillamiento 58°C, 61°C, 64°C, 59°C, 63°C, 60°C, 58°C y 55°C para los genes Avr2,
Avr4, Avr4-E, Avr9, Ecp1, Ecp2, Ecp4 y Ecp5 en ese orden. El producto amplificado
se colocó en un gel de agarosa al 1% y se sometió a electroforesis a 100V por 45
minutos, se visualizó los resultados en un transiluminador mediante luz UV. Se
determinó que los aislados pertenecientes al cantón Tisaleo tienen la presencia única
del gen Avr2 y de los genes Ecp1 y Ecp2. Este trabajo constituye el primer informe
sobre la presencia de genes Avr y Ecp en aislados de C. fulvum en el cantón Tisaleo de
la provincia de Tungurahua.
Keywords
AVIRULENCIA, PCR, C. FULVUM, TOMATE RIÑÓN