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Título : Estudios bioinformáticos para la identificación de posibles dianas terapéuticas en la enfermedad de Esclerosis Lateral Amiotrófica (ELA)
Autor : Galarza Galarza, Cristian Fernando
López Pérez, Iván Gabriel
Palabras clave : BIOINFORMÁTICA
CRIBADO VIRTUAL
DISEÑO DE FÁRMACOS
ACOPLAMIENTO MOLECULAR
ESCLEROSIS LATERAL
AMIOTRÓFICA
Fecha de publicación : sep-2021
Editorial : Universidad Técnica de Ambato. Facultad de Ciencia e Ingeniería en Alimentos y Biotecnología. Carrera de Ingeniería Bioquímica
Resumen : The identification of new therapeutic targets for ALS disease is based on computer-aided drug design (CADD) by analyzing genes such as VCP and VABP against the Drugs-lib database, allowing the best site of action of proteins to be analyzed by virtual screening for drugability. Databases such as MalaCards, OMIM, Harmonizome and KEGG are analyzed to visualize the relevant disease genes. Elite genes that correlate with each other are chosen and grouped according to their dysfunction. In addition, biological networks are created and validated with the DrugBank database. Next, the metabolic pathway of the genes that follow the SOD1 gene mutations is analyzed and the most druggable domains are identified. Finally, the toxicological properties of the linked drugs are analyzed. The search for drug-interacting therapeutic targets is the aim of the present study. The results obtained through virtual screening allow the identification of drugs that may have effects on the disease, these are: Saquinavir and Astemizole, which are associated with the VCP and VABP genes, respectively. The drug Astemizole has better QSAR properties. The importance of the present study is the identification of the most relevant genes and the search for therapeutic targets in Amyotrophic Lateral Sclerosis. The information obtained could be used as a starting point for research into new drugs to counteract neurodegeneration.
Descripción : La identificación de nuevas dianas terapéuticas para la enfermedad de ELA se basa en el diseño de fármacos asistido por computadora (CADD) mediante el análisis de genes como el VCP y VABP frente a la base de datos Drugs-lib, permitiendo analizar el mejor sitio de acción de las proteínas mediante un cribado virtual para comprobar la drugabilidad que poseen. Se analiza las bases de datos, tales como MalaCards, OMIM, Harmonizome y KEGG para visualizar los genes relevantes de la enfermedad. Así, se escoge los genes elite que tienen correlación entre ellos, estos se agrupan de acuerdo con su disfunción. Además, se crean redes biológicas, estas son validadas con la base de datos DrugBank. A continuación, se analiza la ruta metabólica de los genes que siguen las mutaciones del gen SOD1 y se identifican los dominios más drugables. Finalmente, se analiza las propiedades toxicológicas de los fármacos enlazados. La búsqueda de dianas terapéuticas que interactúen con fármacos es el objetivo del presente estudio. Los resultados obtenidos mediante el cribado virtual permiten la identificación de fármacos que pueden tener efectos sobre la enfermedad, estos son: Saquinavir y Astemizole, que están asociados a los genes VCP y VABP, respectivamente. El fármaco Astemizole presenta mejores propiedades QSAR. La importancia del presente estudio es la identificación de los genes con mayor relevancia y la búsqueda de dianas terapéuticas en la Esclerosis Lateral Amiotrófica. La información obtenida podría ser utilizada como punto de partida para la investigación de nuevos fármacos para contrarrestar la neurodegeneración.
URI : https://repositorio.uta.edu.ec/jspui/handle/123456789/33660
Aparece en las colecciones: Carrera Ingeniería Bioquímica

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