Evaluación in silico de la influencia de la heterogeneidad tumoral en la evolución clonal del cáncer de mama
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Date
2025-02
Authors
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Volume Title
Publisher
Universidad Técnica de Ambato. Facultad de Ciencia e Ingeniería en Alimentos y Biotecnología. Carrera de Biotecnología
Abstract
The present study seeks to understand the influence of tumor heterogeneity on cancer progression and metastasis development, proposing a starting point for personalized treatment. Data from breast cancer were used, with sequences from samples belonging to primary tumors and tumors in the lymph nodes. Bioinformatics techniques were applied for processing, and differential expression analysis was used to identify genes that were expressed in each of the experimental conditions. Interaction networks were represented to identify the different interactions of elite genes with other genes. The functionality of these genes was validated using the functional enrichment technique to identify the role that these genes play in cell integrity and homeostasis. A search for variants was performed with the selected genes to identify the influence that these genes have on the development and progression of metastasis. Tumor heterogeneity on clonal evolution was evaluated by analyzing the influence of the variants of each type of tumor, observing that GL has a higher incidence on metastasis compared to TP.
Description
El presente estudio busca comprender la influencia de la heterogeneidad tumoral en la progresión del cáncer y desarrollo de la metástasis planteando un punto de partida para un tratamiento personalizado. Se trabajaron con datos pertenecientes al cáncer de mama, con secuencias de muestras pertenecientes a tumores primarios y tumores en los ganglios linfáticos. Se aplicaron técnicas bioinformáticas para su procesamiento, se empleó un análisis de expresión diferencial para identificar genes que se expresaban en cada una de las condiciones experimentales. Se representaron redes de interacción para identificar las diferentes interacciones de los genes élite con otros genes, se validó la funcionalidad de estos utilizando la técnica de enriquecimiento funcional para identificar el rol que cumplen estos genes en la integridad y homeostasis celular. Con los genes seleccionados se realizó una búsqueda de variantes para identificar la influencia que tienen estos genes en el desarrollo y progresión de la metástasis. Se evalúo la heterogeneidad tumoral sobre la evolución clonal analizando la influencia de las variantes de cada tipo de tumor, observando que GL tiene mayor incidencia sobre la metástasis en comparación con TP.
Keywords
BIOINFORMÁTICA, BIOLOGÍA MOLECULAR, HETEROGENEIDAD TUMORAL, EVOLUCIÓN CLONAL, METÁSTASIS, CÁNCER DE MAMA