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Título : Estudios bioinformáticos de la enzima convertidora de angiotensina en humanos (hACE2) para el desarrollo de posibles inhibidores contra el SARS-CoV-2
Autor : Terán Mera, David Andrés
Hoyos Caicedo, Jhoni Javier
Palabras clave : BIOINFORMÁTICA
DOCKING MOLECULAR
MODELADO MOLECULAR
INHIBIDORES ENZIMÁTICOS
HACE2
SARS-COV-2
Fecha de publicación : ene-2021
Editorial : Universidad Técnica de Ambato. Facultad de Ciencia e Ingeniería en Alimentos y Biotecnología. Carrera de Ingeniería Bioquímica
Resumen : The bioinformatic studies carried out on human angiotensin converting enzyme 2 (hACE2) for the development of possible inhibitors against the SARS-CoV-2 virus, were mainly joint molecular docking. Docking was mainly based on detect interactions between ligands belonging to three libraries. The libraries used were three, CASPeR, ChemBridge and Pathogen Box. From each library, a group of compounds were chosen for docking. From the CASPeR library, the compounds named Drug (3517 ligands) were chosen from the ChemBridge compound library the Fragment Library (10064 ligands) were chosen. Finally, the Pathogen Box compounds (400 ligands), belonging to Medicine for Malaria Venture. The purpose of the present study was to determine the compounds (ligands) that have the potential to be inhibitors of the hACE2 receptor. After analyzing the results by means of binding affinity and intermolecular interactions, 15 ligands with the best interaction were found in the enzyme-ligand complex. These ligands have the potential to be inhibitors of an active site zone, when docking in the amino acids Lysine-31 (Lys-31), Glutamate-35 (Glu-35), Aspartate-38 (Asp-38) and Lysine- 353 (Lys-353). The present study is important since, having carried out docking studies with different ligands, it was possible to obtain those with the best interaction. The results obtained can be used to carry out in vitro and in vivo studies with the virus.
Descripción : Los estudios bioinformáticos realizados en la enzima convertidora de angiotensina 2 en humanos (hACE2) para el desarrollo de posibles inhibidores contra el virus del SARS-CoV-2, fueron principalmente docking molecular conjunto. El docking se basó en realizar interacciones entre ligandos pertenecientes a tres librerías. Las librerías utilizadas fueron tres, CASPeR, ChemBridge y Pathogen Box. De cada librería se escogieron un grupo de compuestos para realizar el docking. De la librería CASPeR se escogieron a los compuestos denominados Drug (3517 ligandos), de la librería de compuestos ChemBridge se escogió a Fragment Library (10064 ligandos). Finalmente, los compuestos de Pathogen Box (400 ligandos), pertenecientes a Medicine For Malaria Venture. La finalidad del presente estudio fue determinar los compuestos (ligandos) que tengan potencial de ser inhibidores del receptor hACE2. Tras el análisis de resultados mediante la afinidad de unión e interacciones intermoleculares, se encontraron a 15 ligandos con mejor interacción en el complejo enzima-ligando. Estos ligandos tienen potencial para ser inhibidores de una zona de sitio activo, ya que se realizó el docking en los aminoácidos Lisina- 31 (Lys-31), Glutamato- 35 (Glu-35), Aspartato- 38 (Asp-38) y Lisina- 353 (Lys-353). El presente estudio tiene importancia ya que al haber realizado estudios de docking con diferentes ligandos, se pudieron obtener los que presentan mejor interacción. Los resultados obtenidos pueden ser usados para realizar estudios in vitro e in vivo con el virus.
URI : https://repositorio.uta.edu.ec/jspui/handle/123456789/32105
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