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Title: Variabilidad de la región its2 en poblaciones de tetranychus urticae koch en el cultivo de arracacia xanthorrhiza bancr.
Authors: Dávila Ponce, Marta
Isabuche Isabuche, Karen Andrea
Keywords: AGRONOMÍA
CULTIVO DE Arracacia
Issue Date: 2019
Abstract: This present study aimed to determine the variability of the ITS2 Region in T. urticae Koch populations collected from A. xanthorrhiza Bancr. from different geographical areas. This study was carried out in the Molecular Biology laboratory of the Faculty of Agricultural Sciences of the Technical University of Ambato. Mature leaves of A. xanthorrhiza infected by the T. urticae were collected from three altitudinal levels from the province of Tungurahua, Quinchicoto (QCH) - Canton Tisaleo at 3,260 meters above sea level, Barrio la "Pampa" - Cantón Baños (B) at 1,947 meters above sea level and the Experimental Teaching Farm "Querochaca" (Q) at 2,865 meters above sea level. The study of the genetic variability was carried out by PCR amplification of the ITS2 fragment. Sequentiation of the three T. urticae populations showed a total of 277 base pairs (bp), with a percentage of divergence of 8.66% and 91.34% similarity. At the same time, the comparisons between the sequences of the three localities indicated 24 total substitutions, thus coinciding the Baños (B) - Quinchicoto (QCH) ratio with the general similarity of 91.34%, the ratio Baños (B) - Querochaca (Q) with 18 substitutions representing 93.3% and the greatest similarity found between Quinchicoto (QCH) - Querochaca (Q) with 6 substitutions representing 97.83%. The composition of the nitrogenous bases for each locality was higher in Adenine (A) with 36.28% (B), 35.86% (QCH) and 36.75% (Q) and Thymine (T) with 42.19% (B), 40.92% (QCH) and 41.77% (Q); conversely lower composition was observed to C (Cytosine) with 18.56% (B), 20.67% (QCH) and 19.4% (Q) and G (Guanine) with 19.83% (B), 19.83% (QCH) and 18.98 % (Q); existing the following A+T ratios: B = 78.47%, QCH = 76.78%, Q = 78.52% for the three altitudinal levels.
Description: RESUMEN En el presente estudio se determinó la variabilidad de la Región ITS2 en poblaciones de T. urticae Koch. colectados en A. xanthorrhiza Bancr. en diferentes zonas geográficas. Este estudio fue realizado en el laboratorio de Biología Molecular de la Facultad de Ciencias Agropecuarias de la Universidad Técnica de Ambato. Se recolectaron hojas maduras de A. xanthorrhiza infectadas por T. urticae de tres pisos altitudinales provenientes de la provincia de Tungurahua, Quinchicoto (QCH) – Cantón Tisaleo a 3.260 m.s.n.m., Barrio la “Pampa” – Cantón Baños (B) a 1.947 m.s.n.m. y la Granja Experimental Docente ´´Querochaca´´ (Q) a 2.865 m.s.n.m. El estudio de la variabilidad genética se realizó mediante la amplificación por PCR del fragmento ITS2, donde al ser secuenciadas las muestras de las tres poblaciones de T. urticae mostró un total de 277 pares de bases (pb), encontrándose un porcentaje de divergencia de nucleótidos de 8,66% y 91,34% de similitud. A la vez, las comparaciones entre las secuencias de las tres localidades indicaron 24 sustituciones totales coincidiendo la relación Baños (B) - Quinchicoto (QCH) con la similitud general de 91,34%, la relación Baños (B)- Querochaca (Q) con 18 sustituciones representando el 93.3% y la mayor similitud hallada entre Quinchicoto (QCH) - Querochaca (Q) con 6 sustituciones representando el 97,83%. La composición de las bases nitrogenadas para cada localidad fue mayor en Adenina (A) con 36.28% (B), 35.86 % (QCH) y 36.75 % (Q) y Timina (T) con 42.19% (B), 40.92% (QCH) y 41.77% (Q); contrariamente la menor composición fue para C (Citosina) con 18.56 %(B), 20,67 % (QCH) y 19,4 % (Q) y G (Guanina) con 19.83 %(B), 19.83% (QCH) y 18.98% (Q); existiendo las siguientes relaciones A+T: B= 78,47%; QCH= 76,78%; Q= 78,52% para los tres pisos altitudinales.
URI: http://repositorio.uta.edu.ec/jspui/handle/123456789/29442
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